Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF542PQ5EBM4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF542PQ5EBM4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms