Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf116Q5BN46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf116Q5BN46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf116Q5BN46 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms