Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM41BQ5BJD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM41BQ5BJD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms