Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYTL3Q4VX76 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYTL3Q4VX76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms