Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q4G0T1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q4G0T1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Q4G0T1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q4G0T1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q4G0T1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q4G0T1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q4G0T1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q4G0T1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q4G0T1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q4G0T1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q4G0T1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q4G0T1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q4G0T1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Q4G0T1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q4G0T1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q4G0T1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q4G0T1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms