Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIT3Q3SXY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIT3Q3SXY7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRIT3Q3SXY7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms