Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLA2G4EQ3MJ16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLA2G4EQ3MJ16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms