Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM12Q3MHD2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM12Q3MHD2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms