Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPRED3Q2MJR0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SPRED3Q2MJR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms