Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GEN1Q17RS7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GEN1Q17RS7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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