Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDR2Q16832 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDR2Q16832 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms