Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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