Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRY1Q16526 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRY1Q16526 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms