Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHI3L2Q15782 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms