Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms