Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALX1Q15699 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALX1Q15699 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALX1Q15699 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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