Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF4Q15306 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF4Q15306 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF4Q15306 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
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