Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRLQ15198 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRLQ15198 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms