Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCA4Q14CN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCA4Q14CN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA4Q14CN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA4Q14CN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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