Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NWD1Q149M9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NWD1Q149M9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NWD1Q149M9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NWD1Q149M9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
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