Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARF1Q14162 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCARF1Q14162 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCARF1Q14162 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
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