Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA1SQ13698 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA1SQ13698 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA1SQ13698 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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