Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PKD2Q13563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PKD2Q13563 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PKD2Q13563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PKD2Q13563 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PKD2Q13563 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PKD2Q13563 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PKD2Q13563 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PKD2Q13563 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PKD2Q13563 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2Q13563 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD2Q13563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD2Q13563 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PKD2Q13563 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD2Q13563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PKD2Q13563 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2Q13563 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
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