Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD4Q13485 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD4Q13485 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD4Q13485 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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