Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SF3B2Q13435 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SF3B2Q13435 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SF3B2Q13435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
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