Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA1Q13330 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA1Q13330 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA1Q13330 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTA1Q13330 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTA1Q13330 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTA1Q13330 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms