Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ARRDC1-208ENST00000475658 854 ntTSL 325.45■■□□□ 1.666e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.596e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.46e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 223.25■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.266e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.216e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.216e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.19e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NARFL-205ENST00000562862 1659 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.676e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NARFL-208ENST00000564285 1350 ntTSL 219.03■□□□□ 0.646e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 518.81■□□□□ 0.66e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SGSM3-207ENST00000469719 1029 ntTSL 518.5■□□□□ 0.556e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 MAIP1-203ENST00000435773 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.59■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.56■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SGSM3-202ENST00000417424 666 ntTSL 517.2■□□□□ 0.346e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.199e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-218ENST00000507704 1031 ntTSL 316.02■□□□□ 0.169e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 ARRDC1-210ENST00000491911 3185 ntTSL 215.43■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.049e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AL590627.2-202ENST00000636318 138 ntTSL 513.81□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 513.47□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 SGSM3-209ENST00000478085 4218 ntTSL 213.22□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.489e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-222ENST00000515794 746 ntTSL 311.35□□□□□ -0.599e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 AFDN-220ENST00000511503 1257 ntTSL 211.35□□□□□ -0.599e-22■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 IMMP2L-208ENST00000487733 580 ntTSL 28.41□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.076e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.226e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-207ENST00000565301 653 ntTSL 27.19□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.376e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.516e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 UGP2-211ENST00000475550 4397 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.646e-8■■■■■ 34.2
PABPC4Q13310 MRPL42-210ENST00000552938 999 ntTSL 212.42□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-207ENST00000551396 725 ntTSL 56.88□□□□□ -1.313e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-201ENST00000358678 2105 ntTSL 1 (best)5.88□□□□□ -1.473e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-205ENST00000549561 775 ntTSL 35.52□□□□□ -1.533e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.663e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.893e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.963e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 526.74■■□□□ 1.873e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 218.17■□□□□ 0.53e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-13■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.524e-7■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-10■■■■■ 34.1
PABPC4Q13310 IDH3A-201ENST00000299518 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 34
PABPC4Q13310 IDH3A-206ENST00000558535 2586 ntTSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 34
PABPC4Q13310 IDH3A-203ENST00000557960 424 ntTSL 35.86□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 34
PABPC4Q13310 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-14■■■■■ 34
PABPC4Q13310 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-14■■■■■ 34
PABPC4Q13310 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-14■■■■■ 34
PABPC4Q13310 ALDH1A2-221ENST00000560312 3146 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.881e-14■■■■■ 34
PABPC4Q13310 ALDH1A2-209ENST00000558384 466 ntTSL 35.45□□□□□ -1.541e-14■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.153e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.123e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 34
PABPC4Q13310 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 34
PABPC4Q13310 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 34
PABPC4Q13310 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 413.95□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 34
PABPC4Q13310 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 34
PABPC4Q13310 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 34
PABPC4Q13310 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 311.64□□□□□ -0.552e-18■■■■■ 34
PABPC4Q13310 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 34
PABPC4Q13310 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.892e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 KAT8-207ENST00000573144 610 ntTSL 222.89■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 KAT8-203ENST00000537402 1345 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 KAT8-204ENST00000538768 2500 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.067e-32■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MIEN1-202ENST00000469568 825 ntTSL 224.73■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MIEN1-204ENST00000498164 925 ntTSL 224.73■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 33.9
PABPC4Q13310 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-8■■■■■ 33.9
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