Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPS1Q13098 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPS1Q13098 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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