Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXF1Q12946 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXF1Q12946 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FOXF1Q12946 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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