Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMARCB1Q12824 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMARCB1Q12824 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
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