Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 TFS1YLR178C 660 nt4.57□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 FAP1YNL023C 2898 nt4.57□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YOL153CYOL153C 1746 nt4.57□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YMR102CYMR102C 2505 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 BSC5YNR069C 1470 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 RTT103YDR289C 1230 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 BCP1YDR361C 852 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YJL218WYJL218W 591 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 ISA1YLL027W 753 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 MAC1YMR021C 1254 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 CBP1YJL209W 1965 nt4.56□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YMR196WYMR196W 3267 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 MRE11YMR224C 2079 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 PEP5YMR231W 3090 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 SCM3YDL139C 672 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 DAM1YGR113W 1032 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 NHP6AYPR052C 282 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 TAF5YBR198C 2397 nt4.55□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 THS1YIL078W 2205 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 MDM34YGL219C 1380 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 PDR10YOR328W 4695 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YDL124WYDL124W 939 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 HNT2YDR305C 654 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 CNL1YDR357C 369 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 TOM40YMR203W 1164 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 BUD17YNR027W 954 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 TOG1YER184C 2385 nt4.54□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 VAC7YNL054W 3498 nt4.53□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 YER158CYER158C 1722 nt4.53□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 PAH1YMR165C 2589 nt4.53□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 EAF5YEL018W 840 nt4.53□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 EAR1YMR171C 1653 nt4.53□□□□□ -1.68
MSH5Q12175 MET4YNL103W 2019 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 XKS1YGR194C 1803 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YJR012CYJR012C 624 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YLR184WYLR184W 348 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 NAT5YOR253W 531 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 OPY2YPR075C 1083 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 IMA3YIL172C 1770 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 IMA4YJL221C 1770 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SLD2YKL108W 1362 nt4.52□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 IML2YJL082W 2196 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 ICE2YIL090W 1476 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YFL068WYFL068W 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SUT1YGL162W 900 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 IPI1YHR085W 1005 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 GTR1YML121W 933 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 MDM12YOL009C 816 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YOR292CYOR292C 930 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YPL077CYPL077C 723 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 KTR3YBR205W 1215 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 UPC2YDR213W 2742 nt4.51□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 LYS21YDL131W 1323 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 GAL83YER027C 1254 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SEH1YGL100W 1050 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 NAT2YGR147C 867 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 TDH3YGR192C 999 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YGR269WYGR269W 327 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YIL028WYIL028W 399 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 HPM1YIL110W 1134 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 UBI4YLL039C 1146 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 CDC42YLR229C 576 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 CSL4YNL232W 879 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 RFA2YNL312W 822 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 RMI1YPL024W 726 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SSB1YDL229W 1842 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SSB2YNL209W 1842 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 RRN11YML043C 1524 nt4.5□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 MMT2YPL224C 1455 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YKR104WYKR104W 921 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 YPR109WYPR109W 885 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 PHO84YML123C 1764 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 NNK1YKL171W 2787 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 CYM1YDR430C 2970 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 PMT5YDL093W 2232 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 AKL1YBR059C 3327 nt4.49□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 RAD28YDR030C 1521 nt4.48□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 ACT1YFL039C 1128 nt4.48□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 ROT1YMR200W 771 nt4.48□□□□□ -1.69
MSH5Q12175 SUP35YDR172W 2058 nt4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms