Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABPB1Q06547 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABPB1Q06547 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms