Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EXOSC9Q06265 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms