Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 PRD1YCL057W 2139 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 PRO3YER023W 861 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 TVP38YKR088C 1014 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 HFA1YMR207C 6372 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 MRL1YPR079W 1146 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 RFT1YBL020W 1725 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 RTC5YOR118W 1704 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 IMA3YIL172C 1770 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 IMA4YJL221C 1770 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 SSB2YNL209W 1842 nt4.34□□□□□ -1.71
NEJ1Q06148 SYP1YCR030C 2613 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 RAD30YDR419W 1899 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 BGL2YGR282C 942 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 JJJ3YJR097W 519 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YPL113CYPL113C 1191 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YMR196WYMR196W 3267 nt4.33□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 HRR25YPL204W 1485 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 MDM34YGL219C 1380 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 DON1YDR273W 1098 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 IRC7YFR055W 1023 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 NAT2YGR147C 867 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 PUS6YGR169C 1215 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YLR194CYLR194C 765 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.32□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 PAH1YMR165C 2589 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 ARP2YDL029W 1176 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 MNN10YDR245W 1182 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 SYN8YAL014C 768 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 snR19snR19 568 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 KGD1YIL125W 3045 nt4.31□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 PUT1YLR142W 1431 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 TRM44YPL030W 1704 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YPL260WYPL260W 1656 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 MET4YNL103W 2019 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YDR134CYDR134C 411 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 NOP16YER002W 696 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YGR182CYGR182C 354 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YJR012CYJR012C 624 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 GPI12YMR281W 915 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 SAM4YPL273W 978 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 POP4YBR257W 840 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 GMC1YDR506C 1827 nt4.3□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 GDE1YPL110C 3672 nt4.29□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YDL124WYDL124W 939 nt4.29□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.29□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 MRPL13YKR006C 795 nt4.29□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 PEP5YMR231W 3090 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 APE1YKL103C 1545 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 IPK1YDR315C 846 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 YDR401WYDR401W 564 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 RPN12YFR052W 825 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 AIM10YER087W 1731 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 GIP1YBR045C 1920 nt4.28□□□□□ -1.72
NEJ1Q06148 ATG1YGL180W 2694 nt4.28□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 ECM7YLR443W 1347 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 TIF4632YGL049C 2745 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 snR7-SsnR7-S 179 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 MHR1YDR296W 681 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 DCD1YHR144C 939 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 CDC42YLR229C 576 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 NPT1YOR209C 1290 nt4.27□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 CNL1YDR357C 369 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 MLC1YGL106W 450 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 ORM1YGR038W 669 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SLZ1YNL196C 897 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 NAT5YOR253W 531 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YPL199CYPL199C 723 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 OPY2YPR075C 1083 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 GRC3YLL035W 1899 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 FDC1YDR539W 1512 nt4.26□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 APC4YDR118W 1959 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 PRP28YDR243C 1767 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 STR2YJR130C 1920 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 PER1YCR044C 1074 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YGR269WYGR269W 327 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 GAT4YIR013C 366 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 CAR1YPL111W 1002 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 TOM5YPR133W-A 153 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 XKS1YGR194C 1803 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 KIC1YHR102W 3243 nt4.25□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 ZPR1YGR211W 1461 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 COT1YOR316C 1320 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 CYM1YDR430C 2970 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 NNK1YKL171W 2787 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YJL218WYJL218W 591 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 FBP1YLR377C 1047 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YNL134CYNL134C 1131 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.24□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SSB1YDL229W 1842 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 KNH1YDL049C 807 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 HST4YDR191W 1113 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 RNA15YGL044C 891 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SMA1YPL027W 738 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 RIM21YNL294C 1602 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 BUD7YOR299W 2241 nt4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms