Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDSRQ06136 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms