Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN11Q06124 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN11Q06124 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN11Q06124 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms