Protein–RNA interactions for Protein: Q04602

VBA4, Vacuolar basic amino acid transporter 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4Q04602 PRM4YPL156C 855 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 UIP4YPL186C 915 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 BBP1YPL255W 1158 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MRPS5YBR251W 924 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CNA1YLR433C 1662 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RAD57YDR004W 1383 nt5.26□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SIR1YKR101W 1965 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 FRS2YFL022C 1512 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR345WYLR345W 1530 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PAD1YDR538W 729 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 DDI2YFL061W 678 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PHB1YGR132C 864 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YIL028WYIL028W 399 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RPC17YJL011C 486 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 ECM1YAL059W 639 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 DDI3YNL335W 678 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 EKI1YDR147W 1605 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PUS9YDL036C 1389 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 THI22YPR121W 1719 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 VPS70YJR126C 2436 nt5.25□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 IFM1YOL023W 2031 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MCM3YEL032W 2916 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 LUC7YDL087C 786 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RPC53YDL150W 1269 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 COS7YDL248W 1152 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RNH202YDR279W 1053 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SUI2YJR007W 915 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 COS5YJR161C 1152 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YML094C-AYML094C-A 402 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 OSW1YOR255W 837 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YCL041CYCL041C 495 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 UBP7YIL156W 3216 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 TIP20YGL145W 2106 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 EPS1YIL005W 2106 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 GUA1YMR217W 1578 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MNS1YJR131W 1650 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 HIR1YBL008W 2523 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CBP1YJL209W 1965 nt5.24□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 TCM62YBR044C 1719 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR290WYDR290W 330 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YHR054CYHR054C 1065 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YKL223WYKL223W 333 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR126CYLR126C 756 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 TIS11YLR136C 858 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CDC73YLR418C 1182 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YMR084WYMR084W 789 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YBR134WYBR134W 402 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MRPL37YBR268W 318 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 GRX1YCL035C 333 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SIS2YKR072C 1689 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MET3YJR010W 1536 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.23□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SNF3YDL194W 2655 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 MCM4YPR019W 2802 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 HSP104YLL026W 2727 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RPN11YFR004W 921 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 PCT1YGR202C 1275 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 RSM26YJR101W 801 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SIC1YLR079W 855 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 CSR1YLR380W 1227 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YNR040WYNR040W 771 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 YBR292CYBR292C 372 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 SSK22YCR073C 3996 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 HMS1YOR032C 1305 nt5.22□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 TBF1YPL128C 1689 nt5.21□□□□□ -1.57
VBA4Q04602 HXT4YHR092C 1731 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 UGX2YDL169C 672 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 YGL199CYGL199C 471 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 YGL218WYGL218W 651 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 RPS10BYMR230W 318 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 SPS18YNL204C 903 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 YOR342CYOR342C 960 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 RPN7YPR108W 1290 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 NTH2YBR001C 2343 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 Q0255Q0255 1419 nt5.21□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 RAD3YER171W 2337 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 TRP3YKL211C 1455 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 ADY3YDL239C 2373 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 GSY2YLR258W 2118 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 CST6YIL036W 1764 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 HST1YOL068C 1512 nt5.2□□□□□ -1.58
VBA4Q04602 DFM1YDR411C 1026 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72.3 ms