Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 KAR2YJL034W 2049 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 PAN1YIR006C 4443 nt4.58□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 HIR2YOR038C 2628 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YGR153WYGR153W 654 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 COS6YGR295C 1146 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YHR140WYHR140W 720 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 TEF4YKL081W 1239 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 SRV2YNL138W 1581 nt4.57□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 PGM2YMR105C 1710 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 CDC10YCR002C 969 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 ARP1YHR129C 1155 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MAP2YBL091C 1266 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MVD1YNR043W 1191 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 ATG18YFR021W 1503 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 ARN1YHL040C 1884 nt4.56□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 ECM7YLR443W 1347 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YDL027CYDL027C 1263 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 GSP2YOR185C 663 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YPL113CYPL113C 1191 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 TIF5YPR041W 1218 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 RAD30YDR419W 1899 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YPS7YDR349C 1791 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 NSI1YDR026C 1713 nt4.55□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 KRE6YPR159W 2163 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 GMC1YDR506C 1827 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 RMR1YGL250W 726 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 PCT1YGR202C 1275 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YKL023WYKL023W 834 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 SPC34YKR037C 888 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 COG5YNL051W 1212 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YNL057WYNL057W 333 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 UBA3YPR066W 900 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YPR109WYPR109W 885 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 STP4YDL048C 1473 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 ESF1YDR365C 1887 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MSE1YOL033W 1611 nt4.54□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MKC7YDR144C 1791 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 SNF11YDR073W 510 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 YHL049CYHL049C 816 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 PEP4YPL154C 1218 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 snR19snR19 568 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 PRP31YGR091W 1485 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MNT2YGL257C 1677 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 SKG3YLR187W 3081 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 MET7YOR241W 1647 nt4.53□□□□□ -1.68
VHS1Q03785 FRS1YLR060W 1788 nt4.53□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 VHS2YIL135C 1311 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 TFB3YDR460W 966 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 GDT1YBR187W 843 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 PRP40YKL012W 1752 nt4.52□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 WTM1YOR230W 1314 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SWI3YJL176C 2478 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YEF1YEL041W 1488 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SUP35YDR172W 2058 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 ENT5YDR153C 1236 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 CAB1YDR531W 1104 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YEL045CYEL045C 426 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 CDS1YBR029C 1374 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 THI20YOL055C 1656 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 GUS1YGL245W 2127 nt4.51□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 GAL4YPL248C 2646 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YMR196WYMR196W 3267 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 TAF10YDR167W 621 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 LYS5YGL154C 819 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SLZ1YNL196C 897 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 ECM2YBR065C 1095 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 HAL1YPR005C 885 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 APC4YDR118W 1959 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 RVB1YDR190C 1392 nt4.5□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 APL6YGR261C 2430 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SRG1SRG1 551 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SUT1YGL162W 900 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 NPT1YOR209C 1290 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 PEX32YBR168W 1242 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SDA1YGR245C 2304 nt4.49□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 PRP28YDR243C 1767 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 KAP114YGL241W 3015 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 GIP2YER054C 1647 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 CPR6YLR216C 1116 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 RDL1YOR285W 420 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 HOS2YGL194C 1359 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 TIF4632YGL049C 2745 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 DIT2YDR402C 1470 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 STR2YJR130C 1920 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 KGD1YIL125W 3045 nt4.48□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YEH2YLR020C 1617 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 NUP1YOR098C 3231 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YDR133CYDR133C 336 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 URA3YEL021W 804 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 ADK2YER170W 678 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 MNN11YJL183W 1269 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 TAF11YML015C 1041 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 LPL1YOR059C 1353 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 YPL245WYPL245W 1365 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SIR2YDL042C 1689 nt4.47□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 MPS3YJL019W 2049 nt4.46□□□□□ -1.69
VHS1Q03785 SAP4YGL229C 2457 nt4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms