Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF8Q02556 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IRF8Q02556 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms