Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHDQ02161 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHDQ02161 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHDQ02161 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHDQ02161 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHDQ02161 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHDQ02161 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHDQ02161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHDQ02161 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHDQ02161 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHDQ02161 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHDQ02161 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHDQ02161 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHDQ02161 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHDQ02161 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms