Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 HPM1YIL110W 1134 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GON7YJL184W 372 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YKR047WYKR047W 306 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YLL059CYLL059C 507 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YLR374CYLR374C 390 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ZRC1YMR243C 1329 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 RSM23YGL129C 1353 nt4.65□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ERG4YGL012W 1422 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ALD3YMR169C 1521 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ALD2YMR170C 1521 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 NQM1YGR043C 1002 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 DAN1YJR150C 897 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CUS2YNL286W 858 nt4.64□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 COQ6YGR255C 1440 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CAB3YKL088W 1716 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 UTP18YJL069C 1785 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YER187WYER187W 426 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YGR182CYGR182C 354 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 VMA16YHR026W 642 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YIL152WYIL152W 708 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MRT4YKL009W 711 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SPC24YMR117C 642 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 RPS15YOL040C 429 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YOL050CYOL050C 321 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 PDX3YBR035C 687 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 DPH2YKL191W 1605 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GGA1YDR358W 1674 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 UTP7YER082C 1665 nt4.63□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MSC7YHR039C 1935 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 PRM2YIL037C 1971 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 TOS3YGL179C 1683 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MTW1YAL034W-A 870 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YKL151CYKL151C 1014 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YNR068CYNR068C 819 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 snR10snR10 245 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CBC2YPL178W 627 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GRE1YPL223C 507 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 STE50YCL032W 1041 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ADE3YGR204W 2841 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 OCA5YHL029C 2040 nt4.62□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ESF1YDR365C 1887 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GCV1YDR019C 1203 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SPR28YDR218C 1272 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YDR249CYDR249C 1122 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SCS2YER120W 735 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YCL041CYCL041C 495 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 FZO1YBR179C 2568 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 RGP1YDR137W 1992 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SMF3YLR034C 1422 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MUP3YHL036W 1641 nt4.61□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GRS1YBR121C 2004 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 OCT1YKL134C 2319 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SLO1YER180C-A 258 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ERG26YGL001C 1050 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ECT1YGR007W 972 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CBF1YJR060W 1056 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YKR041WYKR041W 753 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 NOB1YOR056C 1380 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 TEF1YPR080W 1377 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 TEF2YBR118W 1377 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 RKM2YDR198C 1440 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 MMP1YLL061W 1752 nt4.6□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SYG1YIL047C 2709 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 YIL086CYIL086C 309 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GAT4YIR013C 366 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 PRM10YJL108C 1152 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 SIR1YKR101W 1965 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 CNA1YLR433C 1662 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 GEP3YOR205C 1671 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 COX11YPL132W 903 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 ASA1YPR085C 1332 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 UBC4YBR082C 447 nt4.59□□□□□ -1.67
SKO1Q02100 TCM62YBR044C 1719 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 TOS4YLR183C 1470 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 RMD1YDL001W 1293 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 LDB18YLL049W 540 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ERG3YLR056W 1098 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YLR125WYLR125W 411 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PEX12YMR026C 1200 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YIM2YMR151W 438 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YOR318CYOR318C 306 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YGL036WYGL036W 2730 nt4.58□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YHR045WYHR045W 1683 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 TSL1YML100W 3297 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 FAA3YIL009W 2085 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 NGR1YBR212W 2019 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MTQ2YDR140W 666 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MHR1YDR296W 681 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 PRO3YER023W 861 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YER084WYER084W 387 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 ACT1YFL039C 1128 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 SUA5YGL169W 1281 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YHR127WYHR127W 732 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 XPT1YJR133W 630 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MDY2YOL111C 639 nt4.57□□□□□ -1.68
SKO1Q02100 MRM1YOR201C 1239 nt4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms