Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MYBPC1Q00872 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms