Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK6Q00534 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK6Q00534 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK6Q00534 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms