Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEP78395 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms