Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN2AP68543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN2AP68543 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN2AP68543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms