Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1-1P60608 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1-1P60608 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms