Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPI1P60174 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPI1P60174 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPI1P60174 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TPI1P60174 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPI1P60174 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPI1P60174 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPI1P60174 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPI1P60174 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPI1P60174 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPI1P60174 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPI1P60174 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPI1P60174 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPI1P60174 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPI1P60174 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms