Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX16P57768 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX16P57768 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX16P57768 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX16P57768 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX16P57768 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX16P57768 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX16P57768 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX16P57768 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX16P57768 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX16P57768 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms