Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3BGRP55822 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SH3BGRP55822 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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