Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC13P55735 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC13P55735 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC13P55735 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC13P55735 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC13P55735 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC13P55735 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC13P55735 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC13P55735 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC13P55735 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms