Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN5P54829 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN5P54829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN5P54829 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms